舟山群岛历史悠久。据考古发现，早在5000多年前的新石器时代，舟山群岛上就有人居住。在舟山群岛西北部的马岙镇原始村落遗址上，原始村民们在海边堆积的99座土墩上创造了神秘灿烂的“海岛河姆渡文化”，被誉为“东海第一村”。

    《史记》载：秦朝徐福在东南沿海蓬莱、方丈、瀛洲三岛上寻长生不老的仙药，其中的“蓬莱仙岛”即为舟山境内的岱山岛。据史学家们分析，徐福东渡日本时经过舟山诸岛，现岱山岛上建有“徐福亭”、“东渡纪念碑”等。

    1979年，考古工作者在舟山市定海区马岙镇这个滨海的山丘平原地带各墩地上，发现了面积达14万平方米的古文化遗址群。经初步发掘，有新石器时代遗址12处，文化层厚60-80厘米，出土了一批石器和陶器。有商周时期的文化遗址8处，出土了大量的印纹硬陶。考古工作者认为，这里是舟山先辈最早的集居之地。定海马岙洋坦里，是一个较为完整的新石器时代原始制陶区，面积约1000平方米。在此出土的夹砂红陶碎片上多数留有稻谷痕迹，专家据此认为舟山群岛在5000年前就开始大量栽种水稻,是中国水稻东传日本的海上通道。